Le club est fondé le 19 décembre 1909 sous le nom de BV Borussia 1909 Dortmund (Borussia étant le nom néolatin de la Prusse5) par un groupe de jeunes ouvriers des aciéries de Dortmund et des mineurs. La décision est prise de manière très spontanée, ce qui explique que personne n'a pensé à chercher un nom pour ce nouveau club. Le club est baptisé « Borussia » du nom d'une brasserie locale3. Dans la foulée, Heinrich Unrger devient le premier président du Borussia Dortmund.
Dans les années 1930, le club de la Ruhr est déjà l'une des équipes les plus en vue d'Allemagne.
Comme tant d'autres en Allemagne, le club a pratiquement dû repartir de zéro à l'issue de la Seconde Guerre mondiale. Il est refondé du club sous le nom de SG Borussia 1898 Dortmund dans un premier temps, puis sous son nom définitif BV 09 Borussia Dortmund.
En 1947, le Borussia Dortmund remporte la division de Westphalie (régionale) et évolue l'année suivante en Oberliga Ouest, l'un des cinq groupes régionaux de la première division du championnat allemand, dont les cinq vainqueurs jouent ensuite un mini-championnat qui décide du titre de Champion d’Allemagne. Dortmund remporte les trois premières éditions de sa division : 1948, 1949 et 1950 puis 1953 mais manque les titres de champion d'Allemagne lors des tournois nationaux. Il faut attendre 1956 pour que le Borussia réalise enfin ce « doublé » et devienne pour la première fois champion d’Allemagne. L’année suivante, le club réédite son doublé Oberliga - championnat national et participe à sa première Coupe d’Europe, la Coupe des clubs champions, mais est éliminé dès les huitièmes de finale par Manchester United (0-0 ; 2-3). Un an plus tard, durant la saison 1957-1958, les jaunes et noirs n’atteignent que la cinquième place de leur division Ouest, alors qu'en Coupe des Champions ils atteignent les quarts de finale, où ils échouent face au Milan AC (1-1 ; 1-4). Dortmund termine vice-champion encore en 1961 puis champion d’Allemagne en 1963 bien qu'ayant fini deuxième de sa division.
Continental devient le nouveau sponsor du club qui recrute un défenseur prometteur, Thomas Helmer. Dortmund termine à la 4e place du championnat[réf. nécessaire], son meilleur classement depuis 19 ans. Cette place lui permet de renouer avec l’Europe et les Dortmundern atteignent les huitièmes de finale, éliminés par Bruges. Si l’équipe passe à côté de sa saison 1987-1988, celle qui suit voit l’éclosion d’un nouveau héros au club, Andreas Möller. En 1989, Dortmund renoue avec la victoire en remportant la Coupe d'Allemagne et dans la foulée la Super Coupe allemande. L’année suivante, Möller et les siens terminent à nouveau à la quatrième place et atteignent les huitièmes de finale de la Coupe des Coupes. Toutefois, ils se consolent en démarrant une série de trois titres consécutifs dans la nouvelle Coupe hivernale lors des éditions 1990, 1991 et 1992. En 1990-1991, les résultats sont toutefois décevants. Le BVB termine à la 11e place et est éliminé en huitièmes de finale de la Coupe d'Europe des vainqueurs de coupe de football par les italiens de la Sampdoria (1-1 ; 0-2), qui remporteront la compétition par la suite. Horst Köpel doit démissionner, Ottmar Hitzfeld prend les commandes.
À l’époque les fondateurs avaient peu d’argent, ils ne pouvaient pas acheter un équipement donc ils utilisaient leurs habits du congrès Catholique, une tunique rayés bleu et blanc avec une bande rouge pour se différencier du congrès.